Le fonds documentaire du musée Cognacq-Jay concerne principalement les œuvres, tous domaines confondus (dessins, peintures, sculptures, miniatures, mobilier ou encore objets d’art), qui composent la collection léguée par Ernest Cognacq et son épouse à la Ville de Paris en 1928, ainsi que les œuvres entrées depuis lors au musée pour l’enrichir et la compléter. Il comprend près de 1 200 dossiers d’œuvres auxquels s’ajoutent près de 2 000 ouvrages de bibliothèque, monographies, catalogues d’expositions ou catalogues de collections en lien avec le fonds et les artistes - principalement du XVIIIe siècle -, qui y sont représentés. Le fonds documentaire comprend en outre une documentation presse sur Ernest Cognacq et son épouse, sur la Samaritaine de luxe (1925-1927) et sur l’ouverture du musée Cognacq-Jay boulevard des Capucines en 1929.